Muv-Luv Alternative重制版是发生在Muv-Luv后的故事，主角穿越到另一个平行世界后，决定加入军队，一同反抗外星人的入侵，虽然最后作战失败，然而主角又穿越回到了三年前，这一次他带着未来的记忆，能否成功带领人类战胜外星人的入侵呢？
人物介绍
1、白银武(しろがね たける)声优：相庭刚志/保志总一朗
本作品男主角。隶属于联合国太平洋方面第11军横滨基地卫士训练学校第207卫士训练部队的训练兵(军校毕业后任职少尉)。在UNLIMITED篇之中，原本身为白陵柊学园的学生的他，某日醒来突然进入一个发生了外星人和人类的战争的平行世界，并且被卷入其中。而在本作中他则是经过时间跳跃，而再次回到当初来到平行世界的同一天&同一地点。有着成为卫士的才能。和UNLIMIMTED篇不同的是，现在他持有在UNLIMIMTED篇的三年以来所锻链的军事经验和记忆。但，实际上他似乎有部分记忆流失?
2、鉴纯夏(かがみ すみか)声优：藤原理加/田口宏子
在前作UNLIMITED篇似乎完全没有登场的她，其实已经出现过数次了。而在本作以最重要的女主角身分担纲核心剧情。在UNLIMITED篇中，武曾多次在横滨基地地下研究室中见过的“容器中的人脑”，正是纯夏所有的(所以她本来人格已死)，现时点她是Beta的改造人或生物电脑收集人类情报。而在ALTERNATIVE篇中，夕呼以武从“原来的世界”带回的新理论使纯夏复活为“ALTERNATIVE4”计划的核心·00-UNIT(00单位)。
3、御剑冥夜(みつるぎ めいや)声优：奥田秋/奥岛和美
和武一样身为联合国横滨基地第207训练部队的训练兵(军校毕业后任职少尉)，也是日本帝国政威大将军煌武院悠阳(こうぶいん ゆうひ)的双胞胎妹妹。在前作UNLIMITED篇时得知她是统治日本的将军家族的亲戚，但并未说明详情，而武直到12·5事件才得知真相。擅长接近战(拔刀术)，持有名刀皆琉神威的剑术高手。曾在UNLIMITED篇中豋场，但冥夜始终没搭乘过的专用紫色武御雷，到了ALTERNATIVE篇终于能正式出阵。关于本机体的详情也将在此明了。
4、榊千鹤(さかき ちづる)声优：高柳香帆/仓田雅世
横滨基地207训练部队的训练兵(军校毕业后任职少尉)。是部队的分队长，也是日本帝国内阁总理大臣榊是亲(さかき これちか)的女儿。相当重视规律和上级命令。因此彩峰老是针锋相对，常有对立的状况发生。
游戏设定
1、在现实的重压下，武接受了命运，成为参与人类救援计划的联合国军人，与爱人并肩作战；
2、利益冲突让人类选择放弃地球。三年后，武从沉睡中醒来，本以为回到了“原来的世界”；
3、荒地的景象以及日期都表明他回到了被扔进平行世界的那一天，仿佛一切只是一场梦。
游戏特色
1、集合了收集、养成、战斗、社交等等丰富的元素，招募不同的角色为你而战，和美少女们一起守护世界！
2、由玩家去育成角色，乘上战术机前去战斗的动作RPG；
3、3D战斗场面充满迫力！用技能去改变战况，压制整个战场吧！
游戏玩法
1、但武没有沉浸在困惑与失望中，他决心凭借知晓“未来事件”的优势参与历史，亲手改变人类失败的悲惨“结局”。
2、通过与各种角色互动、参与战斗，利用对未来的了解做出决策推动剧情。武能否带领人类走向胜利，就看你如何操控这场跨越时空的冒险了。